Diagnostika pohybového aparátu je kľúčovou súčasťou úspešnej terapie. Má za úlohu hlbšie preskúmať pozadie problémov a vyhľadať možné príčiny.

Obsahuje vstupný pohovor, anamnézu problému, analýzu MRI prípadne RTG snímkov a zdravotnej dokumentácie, fyzioterapeutické vyšetrenia a merania, analýzu pohybových stereotypov a vzorov.

Výsledkom diagnostiky je návrh rehabilitačnej liečby (procedúry, cvičenia) a vypracovanie rehabilitačného plánu prípadne tréningového plánu (v závislosti od závažnosti nálezu a klienta).